Ukrainian Biological Data Science Summer School 2025: підсумки, враження, результати
Два тижні літнього інтенсиву з біоінформатики пролетіли як одна мить. Ще 19 липня до Ужгорода прямували студенти зі всієї України, а викладачі та асистенти з Японії, Німеччини, Іспанії, США, Польщі, Італії, Бразилії, Швеції, Швейцарії, Естонії, Австрії, Великої Британії та України розробляли навчальні матеріали для учасників, а сьогодні кожен згадує яскраві моменти школи.
Незмінним провідним організатором заходу виступила Школа молекулярної та теоретичної біології (SMTB), науковим директором якої є Федір Кондрашов, професор університету в Окінаві, Японія. І традиційно серед ключових лекторів були Вольфганг Губер, EMBL, Німеччина, статистик, співзасновник Bioconductor, Родерік Гіго і Серра, професор, CRG, Іспанія. Цьогоріч лекторське коло поповнили Олександра Пенковська, професор Інституту експериментальної біології ім. Ненцького Польської академії наук, Польща, Майкл Лав, професор, біостатистика та генетика, Університет Північної Кароліни в Чапел-Гілл, США, Ян Кузел, лабораторія системної біології та біомедичної науки про дані, Університет Констанца. Більше про викладачів тут https://www.bds3.org/faculty
Цьогоріч робота у 14 проєктах вимагала чималих зусиль щодо координації. Команда аспірантів і магістрів, які працюють в Україні та за кордоном, у складі Дарини Завадської, Валерії Васильєвої, Анастасії Горлової, Бориса Оліфірова та Лади Ісакової майстерно організували створення проєктних активностей, що дало креативні результати.
Учасники мали можливість працювати з реальними біологічними даними, поєднуючи знання з біології, програмування, статистики та штучного інтелекту. Програма школи включала низку міждисциплінарних проєктів, що охоплювали ключові напрями сучасної біоінформатики. Серед тем – аналіз 3D-візуалізацій клітинних ядер за допомогою моделей глибокого навчання, вивчення програм реплікації ДНК, метагеноміка одноклітинних еукаріотів, анотація транскриптомів, дослідження мікробіомів, а також аналіз експресії генів із використанням RNA-seq та Bioconductor.
Завдяки роботі в командах, підтримці менторів і доступу до актуальних даних, учасники не лише навчалися сучасним методам, а й робили власний внесок у вирішення складних біологічних питань.
Ukrainian Biological Data Science Summer School не просто об'єднує науковців, а й відкриває можливості для молоді, яка цікавиться біологією у поєднанні з програмуванням, формує нове покоління дослідників, готових працювати на перетині науки, даних і технологій.
